Os grupos de pesquisa vinculados ao MPED e com registro no Diretório dos Grupos de Pesquisa do CNPQ são:
- Cultura Visual, Educação e Linguagem – Cult-Vi
- Grupo de Pesquisa Docência, Narrativas e Diversidade na Educação Básica – DIVERSO
- Grupo de Estudos em Educação Científica-GEEC
- Currículo, Escrevivências e Diferença
- Grupo de Estudos, Pesquisa e Extensão em Educação Especial e Educação Física Adaptada (GEPEFA)
- Diversidade, Formação, Educação Básica e Discursos. (DIFEBA)
- Linguagem, Estudos Culturais e Formação do Leitor (LEFOR)
- Formação, Experiência e Linguagens (FEL)